همزمان با شکل گیری کمیسیون و در همان ماه های اولیه فعالیت در تابستان 1374، نظر به اهمیت ایجاد مرکزی برای گردآوری منابع و اسناد مختلف تخصصی در زمینه حقوق بشرو با توجه به اینکه در آن زمان اصلا چنین مرکزی در ایران وجود نداشت و علیرغم محدودیت شدید منابع و امکانات نهاد تازه شکل گرفته، اقدامات اولیه برای ایجادکتابخانه و مرکز اسناد انجام شد و به تدریج تلاش های مربوطه توسعه یافت به نحوی که مرتبا ضمن تهیه منابع جدید از کشورهای مختلف، مراحل ثبت و ضبط اطلاعات کتابداری در سیستم رایانه ای در سال 1378 به اتمام رسید و پس از آن طی سال ها بعد با تهیه نرم افزار ویژه این امکان فراهم شد که مخاطبان بتوانند از طریق سامانه اطلاع رسانی اینترنتی کمیسیون نیز به اطلاعات کتابداری کلیه منابع موجود در کتابخانه و مرکز اسناد دسترسی پیدا کنند. هم اینک کتابخانه دفتر مرکزی کمیسیون با مجموعه ای بیش از هجده هزار کتاب و اسناد به زبان های فارسی، عربی، فرانسه و اسپانیولی غنی ترین کتابخانه تخصصی حقوق بشر در ایران است که پاسخ گویی نیازهای علمی عموم مراجعین خصوصا محققین، اساتید دانشگاه ها و دانشجویان مخصوصا در مقاطع کارشناسی ارشد و دکترا می باشد.

واحدهای خدمات دهی کتابخانه :

1 – بخش کتاب های مرجع
وجود دایره المعارف های مختلف تخصصی مربوط به حقوق بشر در این بخش از جمله ویژگی های آن می باشد.
2 – بخش کتاب ها و رساله ها
وجود انواع کتاب های تخصصی در زمینه حقوق بشر که احیانا به زبان های مختلف در سطح جهانی منتشر شده هم چنین قسمتی که رساله های دانشگاهی مربوط به حقوق بشر (اهدایی به کمیسیون) را دربرمی گیرد. از جمله ویژگی های این بخش می باشد. معمولا برای اساتید و اعضای هیئت علمی دانشگاه ها امکان مراجعه آزاد به قفسه های کتاب و بررسی مورد به مورد نیز فراهم است.
3- بخش نشریات خارجی و داخلی
وجود نشریات تخصصی مختلف که در سطح جهانی شناخته شده هستند. هم چنین وجود تمامی نشریات حقوقی داخل کشور و خبرنامه های بسیاری از سازمان ها و نهاد های داخلی و خارجی از جمله ویژگی های این بخش است که مراجعه امکان بررسی و مطالعه در کتابخانه را دارند.
4 – بخش لوح های فشرده
در این بخش مهمترین لوح های فشرده در زمینه حقوق بشر اعم از اسناد تخصصی یا فیلم های آموزشی موجود می باشد. همچنین در بخش کتابخانه دیجیتال امکان دسترسی به صدها و ماخذ علمی اعم از کتاب، مقاله یا گزارش در زمینه حقوق بشر فراهم است.
5- بخش خدمات اینترنتی
در این بخش چندین رایانه در اختیار مراجعین است تا بتوانند به صورت رایگان نیازهای اینترنتی خود را در مطالعات مربوط مربوطه رفع نمایید.

عضویت در کتابخانه

در جهت بهره برداری عموم مردم از منابع و اسناد موجود در کتابخانه کمیسیون از سال 1386 این امکان فراهم شده که هر شهروندی بتواند به عضویت کتابخانه درآید و از امانت گیری کتاب استفاده کند. شرایط عضویت در قالب ضوابط مدون در اختیار عموم مراجعین قرار می گیرد.